注重重要的神经、血管等结构的保护，如齿状核、小脑中角、第四脑室底的神经核团及小脑后下动脉。齿状核位于小脑扁桃体上极外侧，损伤可导致严重的平衡失调和意向性震颤。而在第四脑室顶或侧隐窝进行操作时，可能损伤小脑上、下角， 导致共济失调、辨距障碍、肌张力降低和意向性震颤。小脑后下动脉或其分支可能被肿瘤包裹或移位，术中一定要考虑到这些因素。如果损伤了小脑后下动脉在小脑扁桃体上极发出的分支，可以引起站立或行走不稳及眼球震颤，而其主干损伤常可致命。如手术损伤桥脑延髓神经核团或延髓闩部，术后可出现严重的吞咽困难，甚至消化道出血、呼吸障碍。
