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下丘脑错构瘤
下丘脑错构瘤是临床极为罕见的先天性脑组织发育异常性病变，而并非真性肿瘤。人群发病率约为1/5-10万，女性稍多于男性。主要于婴幼儿及儿童期发病，平均发病年龄为22个月。主要有性早熟、痴笑性癫痫。病人症状与错构瘤直接相关，因下丘脑错构瘤位于下丘脑、三脑室底等重要部位，手术难度大，术后并发症多，2015年始，癫痫中心开展机器人辅助下立体电极置入及毁损手术，术后癫痫完全缓解率超过85%。是目前治疗下丘脑错构瘤为有效及安全的方法。
脑皮质皮质发育不良
儿童癫痫近30%病例为各种程度的脑皮质发育不良导致，三博脑科医院应用高清核磁共振检查结合皮层脑电图，对儿童儿童脑皮质发育不良的确诊率超过90%，85%以上，每年根治80例以上皮质发育不良病例。对600例儿童药物难治性癫痫的药物与手术对比研究发现，手术明显提高病人癫痫控制效果与术后正常与学习能力。
结节性硬化大症
药物治疗为主及手术治疗为辅助的综合治疗策略。对于发作频率不高且对药物反应好的患儿，优先选用药物治疗。对于药物难以控制或结节数量在1-3个的结节硬化患者，神经导航下高选择性责任结节切除是有效控制癫痫发作的方法，且高选择性切除不损伤患者脑功能。三博手术治疗80例结节硬化患者，效果满意率超过85%。
儿童颜面血管瘤病(Sturge-Weber综合症)
三博完成了国内病例数的儿童颜面血管瘤病(Sturge-Weber综合症)外科手术。确定了强化核磁共振、平扫CT与视频脑电图为评估该疾病的佳手段，该病90%病例起病年龄1岁以内，且多为药物难治，需要手术根治。儿童颜面血管瘤病佳手术治疗年龄为1-3岁。
Rasmussen脑炎
自2004年至今诊治儿童罕见的Rasmussen脑炎60例，为目前国际上有经验的Rasmussen脑炎诊断与治疗中心。提出了动态影像学观察、联合PET及脑磁图并病理活检诊断影像学阴性及轻微病变的Rasmussen脑炎的诊断新思路。
